Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5G2

Pcdhb9, Protocadherin beta 9, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb9E9Q5G2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcdhb9E9Q5G2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcdhb9E9Q5G2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Pcdhb9E9Q5G2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcdhb9E9Q5G2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcdhb9E9Q5G2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms