Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Pdzd2E9Q1M1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Pdzd2E9Q1M1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Pdzd2E9Q1M1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Pdzd2E9Q1M1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Pdzd2E9Q1M1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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