Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Chd2E9PZM4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Chd2E9PZM4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Chd2E9PZM4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Chd2E9PZM4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Chd2E9PZM4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Chd2E9PZM4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Chd2E9PZM4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Chd2E9PZM4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Chd2E9PZM4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Chd2E9PZM4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Chd2E9PZM4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Chd2E9PZM4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Chd2E9PZM4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Chd2E9PZM4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Chd2E9PZM4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Chd2E9PZM4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Chd2E9PZM4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Chd2E9PZM4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Chd2E9PZM4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Chd2E9PZM4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Chd2E9PZM4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chd2E9PZM4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chd2E9PZM4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chd2E9PZM4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chd2E9PZM4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chd2E9PZM4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chd2E9PZM4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chd2E9PZM4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chd2E9PZM4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chd2E9PZM4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chd2E9PZM4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chd2E9PZM4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chd2E9PZM4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chd2E9PZM4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chd2E9PZM4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms