Protein–RNA interactions for Protein: E9PUZ9

Pdzrn4, PDZ domain-containing RING finger 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn4E9PUZ9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzrn4E9PUZ9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzrn4E9PUZ9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms