Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clca3bE9PUL3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clca3bE9PUL3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms