Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrc5C3VPR6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrc5C3VPR6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrc5C3VPR6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms