Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Kpna7C0LLJ0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms