Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tmf1B9EKI3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tmf1B9EKI3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Tmf1B9EKI3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tmf1B9EKI3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tmf1B9EKI3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tmf1B9EKI3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tmf1B9EKI3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tmf1B9EKI3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tmf1B9EKI3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tmf1B9EKI3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tmf1B9EKI3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tmf1B9EKI3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tmf1B9EKI3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tmf1B9EKI3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tmf1B9EKI3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tmf1B9EKI3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tmf1B9EKI3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tmf1B9EKI3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tmf1B9EKI3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tmf1B9EKI3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tmf1B9EKI3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tmf1B9EKI3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tmf1B9EKI3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tmf1B9EKI3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tmf1B9EKI3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tmf1B9EKI3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tmf1B9EKI3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tmf1B9EKI3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tmf1B9EKI3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tmf1B9EKI3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tmf1B9EKI3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tmf1B9EKI3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tmf1B9EKI3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms