Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usf3B2RUQ2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms