Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrn3B2RS91 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrn3B2RS91 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
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