Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NhsB1AV60 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
NhsB1AV60 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NhsB1AV60 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
NhsB1AV60 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NhsB1AV60 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
NhsB1AV60 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NhsB1AV60 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NhsB1AV60 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NhsB1AV60 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NhsB1AV60 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NhsB1AV60 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NhsB1AV60 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NhsB1AV60 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NhsB1AV60 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NhsB1AV60 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NhsB1AV60 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NhsB1AV60 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NhsB1AV60 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NhsB1AV60 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NhsB1AV60 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NhsB1AV60 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NhsB1AV60 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NhsB1AV60 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NhsB1AV60 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms