Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Frmpd1A2AKB4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Frmpd1A2AKB4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Frmpd1A2AKB4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Frmpd1A2AKB4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Frmpd1A2AKB4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Frmpd1A2AKB4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Frmpd1A2AKB4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Frmpd1A2AKB4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Frmpd1A2AKB4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Frmpd1A2AKB4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Frmpd1A2AKB4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Frmpd1A2AKB4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Frmpd1A2AKB4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Frmpd1A2AKB4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Frmpd1A2AKB4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Frmpd1A2AKB4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Frmpd1A2AKB4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Frmpd1A2AKB4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Frmpd1A2AKB4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Frmpd1A2AKB4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Frmpd1A2AKB4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Frmpd1A2AKB4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Frmpd1A2AKB4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Frmpd1A2AKB4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Frmpd1A2AKB4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Frmpd1A2AKB4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Frmpd1A2AKB4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Frmpd1A2AKB4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Frmpd1A2AKB4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Frmpd1A2AKB4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Frmpd1A2AKB4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Frmpd1A2AKB4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Frmpd1A2AKB4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Frmpd1A2AKB4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Frmpd1A2AKB4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Frmpd1A2AKB4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Frmpd1A2AKB4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Frmpd1A2AKB4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Frmpd1A2AKB4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Frmpd1A2AKB4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Frmpd1A2AKB4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Frmpd1A2AKB4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Frmpd1A2AKB4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Frmpd1A2AKB4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Frmpd1A2AKB4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Frmpd1A2AKB4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Frmpd1A2AKB4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Frmpd1A2AKB4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Frmpd1A2AKB4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Frmpd1A2AKB4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Frmpd1A2AKB4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Frmpd1A2AKB4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Frmpd1A2AKB4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Frmpd1A2AKB4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Frmpd1A2AKB4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Frmpd1A2AKB4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Frmpd1A2AKB4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Frmpd1A2AKB4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Frmpd1A2AKB4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Frmpd1A2AKB4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Frmpd1A2AKB4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Frmpd1A2AKB4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Frmpd1A2AKB4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Frmpd1A2AKB4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Frmpd1A2AKB4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Frmpd1A2AKB4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Frmpd1A2AKB4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms