Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trav12-2A0N8N6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms