Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDU8

Cc2d2b, Coiled-coil and C2 domain containing 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2bA0A286YDU8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Cc2d2bA0A286YDU8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Cc2d2bA0A286YDU8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Cc2d2bA0A286YDU8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Cc2d2bA0A286YDU8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Cc2d2bA0A286YDU8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cc2d2bA0A286YDU8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Cc2d2bA0A286YDU8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cc2d2bA0A286YDU8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cc2d2bA0A286YDU8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Cc2d2bA0A286YDU8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cc2d2bA0A286YDU8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cc2d2bA0A286YDU8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cc2d2bA0A286YDU8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cc2d2bA0A286YDU8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cc2d2bA0A286YDU8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cc2d2bA0A286YDU8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cc2d2bA0A286YDU8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cc2d2bA0A286YDU8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cc2d2bA0A286YDU8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cc2d2bA0A286YDU8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Cc2d2bA0A286YDU8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cc2d2bA0A286YDU8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cc2d2bA0A286YDU8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cc2d2bA0A286YDU8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cc2d2bA0A286YDU8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cc2d2bA0A286YDU8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cc2d2bA0A286YDU8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cc2d2bA0A286YDU8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cc2d2bA0A286YDU8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cc2d2bA0A286YDU8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cc2d2bA0A286YDU8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cc2d2bA0A286YDU8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cc2d2bA0A286YDU8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Cc2d2bA0A286YDU8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cc2d2bA0A286YDU8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cc2d2bA0A286YDU8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Cc2d2bA0A286YDU8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cc2d2bA0A286YDU8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cc2d2bA0A286YDU8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cc2d2bA0A286YDU8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cc2d2bA0A286YDU8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cc2d2bA0A286YDU8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cc2d2bA0A286YDU8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cc2d2bA0A286YDU8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cc2d2bA0A286YDU8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cc2d2bA0A286YDU8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cc2d2bA0A286YDU8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cc2d2bA0A286YDU8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cc2d2bA0A286YDU8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cc2d2bA0A286YDU8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cc2d2bA0A286YDU8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cc2d2bA0A286YDU8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cc2d2bA0A286YDU8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cc2d2bA0A286YDU8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cc2d2bA0A286YDU8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cc2d2bA0A286YDU8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cc2d2bA0A286YDU8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cc2d2bA0A286YDU8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cc2d2bA0A286YDU8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cc2d2bA0A286YDU8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cc2d2bA0A286YDU8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cc2d2bA0A286YDU8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cc2d2bA0A286YDU8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cc2d2bA0A286YDU8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cc2d2bA0A286YDU8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Cc2d2bA0A286YDU8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Cc2d2bA0A286YDU8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Cc2d2bA0A286YDU8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Cc2d2bA0A286YDU8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cc2d2bA0A286YDU8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cc2d2bA0A286YDU8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cc2d2bA0A286YDU8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cc2d2bA0A286YDU8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cc2d2bA0A286YDU8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cc2d2bA0A286YDU8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cc2d2bA0A286YDU8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cc2d2bA0A286YDU8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cc2d2bA0A286YDU8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cc2d2bA0A286YDU8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cc2d2bA0A286YDU8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cc2d2bA0A286YDU8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cc2d2bA0A286YDU8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cc2d2bA0A286YDU8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cc2d2bA0A286YDU8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cc2d2bA0A286YDU8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cc2d2bA0A286YDU8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Cc2d2bA0A286YDU8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cc2d2bA0A286YDU8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cc2d2bA0A286YDU8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cc2d2bA0A286YDU8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms