Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Ndufs3Q9DCT2 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms