Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg9Q9DB90 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Smg9Q9DB90 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Smg9Q9DB90 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Smg9Q9DB90 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Smg9Q9DB90 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Smg9Q9DB90 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Smg9Q9DB90 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Smg9Q9DB90 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Smg9Q9DB90 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Smg9Q9DB90 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Smg9Q9DB90 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Smg9Q9DB90 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Smg9Q9DB90 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms