Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms