Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp12Q9D9M2 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms