Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.3 ms