Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms