Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ncapd2Q8K2Z4 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ncapd2Q8K2Z4 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ncapd2Q8K2Z4 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ncapd2Q8K2Z4 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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