Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms