Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brf1Q8CFK2 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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