Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44236-201ENSMUST00000204492 513 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 AC165260.2-201ENSMUST00000225371 395 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Tnrc6bQ8BKI2 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnrc6bQ8BKI2 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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