Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Gm9597-202ENSMUST00000227632 1387 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Med21-203ENSMUST00000111650 572 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Rhox3f-201ENSMUST00000115172 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Rhox3g-201ENSMUST00000119965 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Gm13941-201ENSMUST00000127918 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Rhox3f-203ENSMUST00000184451 1008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Gm18183-201ENSMUST00000191024 615 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Gm43674-201ENSMUST00000196313 791 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Gm45889-201ENSMUST00000209535 1057 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 AC167222.1-201ENSMUST00000219379 660 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Gm19073-201ENSMUST00000219978 555 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 AC165437.1-201ENSMUST00000228640 536 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Vmn1r17-203ENSMUST00000228156 2090 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ClmQ7TSN2 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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