Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms