Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Stard3nl-205ENSMUST00000197565 1391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Fhl3-202ENSMUST00000106199 1139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm14156-201ENSMUST00000121538 483 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm16013-201ENSMUST00000152249 353 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Slirp-202ENSMUST00000160488 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Rpl17-ps11-201ENSMUST00000161946 729 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 AC156561.1-201ENSMUST00000224774 233 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm26132-201ENSMUST00000083166 148 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Ifna6-201ENSMUST00000105146 570 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Rgs8-205ENSMUST00000111815 765 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm16301-201ENSMUST00000161959 295 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm44173-201ENSMUST00000204316 132 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Polr2k-201ENSMUST00000057177 601 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Ifna1-201ENSMUST00000094972 570 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
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