Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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Pkp4Q68FH0 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Pkp4Q68FH0 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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