Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm28047Q3US59 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm28047Q3US59 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gm28047Q3US59 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gm28047Q3US59 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gm28047Q3US59 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gm28047Q3US59 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28047Q3US59 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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