Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms