Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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