Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tra2bP62996 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms