Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm42764-201ENSMUST00000197835 741 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Anapc15-203ENSMUST00000098237 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Gm4880-201ENSMUST00000207645 1696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Gm11701-201ENSMUST00000121277 1142 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chd1P40201 AC140393.4-201ENSMUST00000226994 765 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Tff3-201ENSMUST00000024827 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Cst13-201ENSMUST00000046589 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chd1P40201 1700013G24Rik-201ENSMUST00000048893 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Polr2k-201ENSMUST00000057177 601 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chd1P40201 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Glns-ps1-201ENSMUST00000120291 1118 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Gm16058-201ENSMUST00000124392 427 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Gm23563-201ENSMUST00000174900 251 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Gm26810-201ENSMUST00000181153 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Gm7210-201ENSMUST00000209309 1067 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Gm35696-202ENSMUST00000220364 778 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Gm18030-201ENSMUST00000222163 731 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 CT025689.5-201ENSMUST00000224316 986 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 AC149294.3-201ENSMUST00000226888 732 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Gm8991-201ENSMUST00000073014 1075 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Smok3c-202ENSMUST00000178402 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Vmn1r44-203ENSMUST00000226120 1772 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Fsip1-202ENSMUST00000028821 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Rab7b-201ENSMUST00000064664 1672 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Gm44167-201ENSMUST00000204957 1878 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Gm11307-201ENSMUST00000121088 929 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 6330418K02Rik-202ENSMUST00000125662 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 1700092M07Rik-201ENSMUST00000163172 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Mir5108-201ENSMUST00000175276 85 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 A930033M14Rik-201ENSMUST00000217206 400 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 AC108416.3-201ENSMUST00000226148 557 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Figla-201ENSMUST00000032070 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 n-R5s25-201ENSMUST00000082923 119 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Sectm1a-201ENSMUST00000026162 1692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Pdgfd-202ENSMUST00000168039 1795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chd1P40201 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chd1P40201 AC160138.2-201ENSMUST00000220255 1531 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Fhl3-202ENSMUST00000106199 1139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Gm25319-201ENSMUST00000122552 325 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Gm35299-201ENSMUST00000195865 421 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chd1P40201 AC124400.2-201ENSMUST00000224939 253 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chd1P40201 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chd1P40201 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms