Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
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Tsta3P23591 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Tsta3P23591 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Tsta3P23591 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
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Tsta3P23591 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tsta3P23591 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Tsta3P23591 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tsta3P23591 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tsta3P23591 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tsta3P23591 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tsta3P23591 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tsta3P23591 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tsta3P23591 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tsta3P23591 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tsta3P23591 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tsta3P23591 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tsta3P23591 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tsta3P23591 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tsta3P23591 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tsta3P23591 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tsta3P23591 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tsta3P23591 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tsta3P23591 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tsta3P23591 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tsta3P23591 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tsta3P23591 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms