Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Rian-208ENSMUST00000182370 352 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm38145-201ENSMUST00000192319 693 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm5072-201ENSMUST00000063726 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm5507-201ENSMUST00000091897 1008 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Tulp2-203ENSMUST00000107758 1597 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Snx10-202ENSMUST00000114439 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Defa-rs1P17533 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm20483-201ENSMUST00000173162 851 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Defa-rs1P17533 Gm45090-201ENSMUST00000208775 1148 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms