Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 4932431P20Rik-202ENSMUST00000141713 9288 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Eya3-213ENSMUST00000180250 5020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 555.1 ms