Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-AaP01910 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms