Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Gm18980-201ENSMUST00000199098 1079 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Minpp1-ps-201ENSMUST00000203344 946 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Gm44266-201ENSMUST00000205235 500 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Gm45554-201ENSMUST00000210731 1004 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Gm5789-201ENSMUST00000222643 865 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 E430024I08Rik-202ENSMUST00000220632 1513 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhx8O35652 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Olfr444-202ENSMUST00000204092 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Lhx8O35652 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Lhx8O35652 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Lhx8O35652 Cldn34c1-206ENSMUST00000169445 705 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Lhx8O35652 Esp38-201ENSMUST00000178880 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Lhx8O35652 9330179D12Rik-202ENSMUST00000180811 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Lhx8O35652 Ngf-204ENSMUST00000198644 1120 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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Lhx8O35652 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Med6-201ENSMUST00000002756 1003 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Ubd-201ENSMUST00000038844 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm25410-201ENSMUST00000083758 137 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm21719-202ENSMUST00000189073 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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