Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Gm9929-201ENSMUST00000171747 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2056J3QQ02 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms