Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
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Gm20795J3QP49 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
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Gm20795J3QP49 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
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Gm20795J3QP49 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
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Gm20795J3QP49 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
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Gm20795J3QP49 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
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Gm20795J3QP49 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
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Gm20795J3QP49 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
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Gm20795J3QP49 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
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Gm20795J3QP49 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
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Gm20795J3QP49 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms