Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Pfkfb3-216ENSMUST00000191668 2216 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Eng-205ENSMUST00000167841 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Pex5l-204ENSMUST00000108224 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Evc-203ENSMUST00000114154 3695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Alox8-201ENSMUST00000021262 3226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm32552-201ENSMUST00000217849 2291 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Sema4d-203ENSMUST00000110040 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Trak1-211ENSMUST00000211187 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Ash2l-203ENSMUST00000110609 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 F730016J06Rik-203ENSMUST00000156508 2593 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Tomm40l-203ENSMUST00000111327 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Zmiz2-204ENSMUST00000109786 4319 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Sftpa1-202ENSMUST00000170719 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gpr63-201ENSMUST00000038920 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gtpbp8-204ENSMUST00000162512 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Galnt1-201ENSMUST00000000430 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Nolc1-209ENSMUST00000225780 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Cdkn1b-202ENSMUST00000067327 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Mid1-204ENSMUST00000112104 3860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Nedd4l-211ENSMUST00000226058 3393 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 D130017N08Rik-202ENSMUST00000180951 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Psat1-201ENSMUST00000025542 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 4930503B20Rik-201ENSMUST00000049703 2080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Tnfsf18-201ENSMUST00000086084 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Pigq-202ENSMUST00000097368 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 4932430I15Rik-201ENSMUST00000180431 3306 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Tgm7-201ENSMUST00000110675 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Foxp2-205ENSMUST00000115474 2544 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Npas4-201ENSMUST00000056129 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Il1f5-206ENSMUST00000168941 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Mitf-202ENSMUST00000043637 4881 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Fes-208ENSMUST00000206728 2707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 9230112E08Rik-202ENSMUST00000189441 3352 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Pi4ka-211ENSMUST00000154364 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Vps8-205ENSMUST00000118138 3060 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Pde9a-206ENSMUST00000134525 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Inpp4a-207ENSMUST00000136846 3576 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Pwp1-201ENSMUST00000001836 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm12830-201ENSMUST00000137570 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms