Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
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PtprbB2RU80 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
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PtprbB2RU80 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
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PtprbB2RU80 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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PtprbB2RU80 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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PtprbB2RU80 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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PtprbB2RU80 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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PtprbB2RU80 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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PtprbB2RU80 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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PtprbB2RU80 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
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