Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms