Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms