Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ49

Ncbp2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp2Q9CQ49 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ncbp2Q9CQ49 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ncbp2Q9CQ49 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ncbp2Q9CQ49 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ncbp2Q9CQ49 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ncbp2Q9CQ49 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ncbp2Q9CQ49 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ncbp2Q9CQ49 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ncbp2Q9CQ49 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ncbp2Q9CQ49 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ncbp2Q9CQ49 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ncbp2Q9CQ49 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ncbp2Q9CQ49 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ncbp2Q9CQ49 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ncbp2Q9CQ49 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ncbp2Q9CQ49 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ncbp2Q9CQ49 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ncbp2Q9CQ49 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ncbp2Q9CQ49 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ncbp2Q9CQ49 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ncbp2Q9CQ49 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Ncbp2Q9CQ49 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ncbp2Q9CQ49 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ncbp2Q9CQ49 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ncbp2Q9CQ49 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ncbp2Q9CQ49 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ncbp2Q9CQ49 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ncbp2Q9CQ49 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ncbp2Q9CQ49 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms