Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 1700028K03Rik-202ENSMUST00000159902 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Ifna11-201ENSMUST00000170428 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Gm23521-201ENSMUST00000177845 110 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Gm7672-201ENSMUST00000180915 872 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Rps27-202ENSMUST00000195998 458 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Gm33969-201ENSMUST00000197615 388 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Gm8960-201ENSMUST00000219787 788 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Phf5a-201ENSMUST00000023117 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Ifna1-201ENSMUST00000094972 570 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Igsf5-201ENSMUST00000000163 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Fam240a-201ENSMUST00000177678 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Gm5845-201ENSMUST00000195812 796 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 CT009550.1-201ENSMUST00000225750 864 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Gal-201ENSMUST00000025842 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Elf2-213ENSMUST00000195432 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Gm44805-201ENSMUST00000127648 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Gm15587-202ENSMUST00000156403 709 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Gm21083-201ENSMUST00000188807 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Gm44460-201ENSMUST00000196179 129 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Dtymk-203ENSMUST00000112893 1040 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Mrps33-202ENSMUST00000114797 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Gm26021-201ENSMUST00000158664 131 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrbp1Q99PL5 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms