Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
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