Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
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