Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef8Q8CE24 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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