Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cwc22Q8C5N3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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